Смутное время на Марийской земле
События "смуты" начала XVII века не миновали и Царевококшайск. В 1605-1606 годах царевококшайские воеводы от имени города были на стороне Лжедмитрия I . В последующем различные группировки придерживались разной ориентации, в том числе были отряды, участвовавшие в разгроме повстанческих сил Ивана Болотникова. В 1609 году город присягнул Лжедмитрию II, "воровские" отряды, состоявшие из черемисских и русских служилых людей, захватив город, пытались активно действовать в отношении северных и северо-восточных городов и земель, но вскоре, в том же году, крупные воинские силы, верные царю Василию Шуйскому, прибыли сюда от Казани и захватили Царевококшайск. Об участии царевококшайцев в ополчении Минина и Пожарского по освобождению Москвы от поляков документальных свидетельств не имеется, хотя об этом немало сюжетов в беллетристике.
В XVII веке основную часть населения Царевококшайска по-прежнему составляли военные. Значительный для того времени гарнизон содержался для подавления возможного недовольства населения как в самом городе, так и в окружающей местности. В 1663 году, например, здесь имелось 232 "служилых" человека, в основном стрельцы. Вообще в Царевококшайске ежегодно служили не менее 200 стрельцов, переведенных из центральных уездов. Вместе с ними исполняли свои обязанности (но жили в отдельной слободе за городом, за Кокшагой) "служилые новокрещены" (30-40 человек ежегодно). Те и другие в необходимых случаях переводились на службу в пограничные южные и западные районы, на строительство "засечных черт" по границе со степью. В частности, в начале 1660-х годов в связи со сравнительно спокойной обстановкой в марийском крае и неспокойной ситуацией на юге здесь было оставлено лишь 30 стрельцов и 2 пушкаря, а 130 стрельцов и 30 служилых новокрещенов были отправлены на степные границы. Да и в мирные годы Царевококшайск должен был поддерживать тех, кто служил на южных рубежах: среди многочисленных повинностей горожан (выплата стрелецких, ямских, полоняничных денег) имелись задания по переработке сельскохозяйственной продукции и отправке "в низовой астраханский отпуск".
В середине XVII века вокруг Царевококшайска разместилось около 20 деревень, принадлежавших царскому двору. Крестьяне этих дворцовых деревень социально-экономически тесно были связаны с городом. Числясь в деревнях, некоторые из них жили в городе. Немало крестьян семьями занимались разнообразными ремеслами, выполняя работы на заказ. Постепенно некоторые из них переходили к реализации своих изделий "на торгу в разных местах", в первую очередь, на царевококшайском базаре, то есть они становились мелкими товаропроизводителями и втягивались в торговлю. Часть царевококшайского посадского населения уже тогда занималась покупкой и продажей скота и продуктов животноводства. На царевококшайском базаре имелись "скотинный" и мясной ряды. Некоторые жители города даже имели связанные с этими занятиями прозвища, из которых образовались фамилии: "Федька Степанов сын Кожевник - ремесло за ним - кожевное делает"; "Шумилко Семенов сын Мясник - торгует в мясном ряду".